Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RAB39AQ14964 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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RAB39AQ14964 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RAB39AQ14964 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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