Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SCARF1Q14162 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARF1Q14162 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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