Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
IRF5Q13568 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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