Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TCIRG1Q13488 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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TCIRG1Q13488 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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TCIRG1Q13488 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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TCIRG1Q13488 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TCIRG1Q13488 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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