Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CLN3Q13286 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLN3Q13286 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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