Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CHRNEQ04844 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms