Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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HOXD10P28358 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD10P28358 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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