Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PRPF40AO75400 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PRPF40AO75400 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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