Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC61Q9Y6R9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC61Q9Y6R9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms