Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms