Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VPS4AQ9UN37 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS4AQ9UN37 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms