Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLIP2Q9UDT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms