Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms