Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC39A9Q9NUM3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC39A9Q9NUM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms