Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1DQ9H5J8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1DQ9H5J8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms