Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDGFDQ9GZP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms