Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCO2Q9BYV7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms