Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HIRIP3Q9BW71 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HIRIP3Q9BW71 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms