Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3R4Q99570 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3R4Q99570 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms