Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCHS1Q96JQ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms