Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC12Q96GR4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms