Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms