Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VTI1AQ96AJ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms