Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP9XQ93008 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms