Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRIPQ8WXE1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms