Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C4orf3Q8WVX3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms