Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRINP3Q76B58 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRINP3Q76B58 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms