Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
C16orf54Q6UWD8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms