Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A10Q6U841 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms