Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATAD2Q6PL18 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATAD2Q6PL18 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms