Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM46CQ5VWP2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms