Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD1Q5T700 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD1Q5T700 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms