Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KHDC3LQ587J8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms