Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
QSER1Q2KHR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
QSER1Q2KHR3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms