Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIDA1Q1XH10 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms