Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KNOP1Q1ED39 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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