Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL24A1Q17RW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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