Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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