Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKIV2LQ15477 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKIV2LQ15477 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms