Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms