Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTAN1Q13813 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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