Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LRP1Q07954 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms