Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms