Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYP4A11Q02928 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms