Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDR2Q01850 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms