Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms