Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNPDA1P46926 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNPDA1P46926 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms