Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ACADSBP45954 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ACADSBP45954 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms