Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE6BP35913 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE6BP35913 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms