Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF1P30408 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF1P30408 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms